事業(yè)單位職工可以申請勞動仲裁。勞動爭議仲裁調(diào)解法適用于中華人民共和國用人單位與勞動者之間的任何勞動爭議;勞動爭議仲裁委員會負(fù)責(zé)管轄該地區(qū)的勞動爭議。所以，事業(yè)單位發(fā)生的勞動爭議由當(dāng)?shù)貏趧訝幾h仲裁委員會管轄。

事業(yè)單位參與勞動仲裁活動，提供充分證據(jù)，有可能勝訴。勞動爭議案件當(dāng)事人應(yīng)當(dāng)承擔(dān)舉證責(zé)任，事業(yè)單位應(yīng)當(dāng)掌握與爭議事項有關(guān)的管理證據(jù)，承擔(dān)舉證責(zé)任，未經(jīng)舉證的，應(yīng)當(dāng)承擔(dān)不利后果。證據(jù)包括勞動合同、考勤、社保繳費、工資單或銀行流水、工作許可證、工作服等。

法律依據(jù)：

《中華人民共和國勞動爭議調(diào)解仲裁法》第六條

發(fā)生勞動爭議，當(dāng)事人對自己提出的主張，有責(zé)任提供證據(jù)。與爭議事項有關(guān)的證據(jù)屬于用人單位掌握管理的，用人單位應(yīng)當(dāng)提供;用人單位不提供的，應(yīng)當(dāng)承擔(dān)不利后果。

《中華人民共和國勞動爭議調(diào)解仲裁法》第三十九條

當(dāng)事人提供的證據(jù)經(jīng)查證屬實的，仲裁庭應(yīng)當(dāng)將其作為認(rèn)定事實的根據(jù)。

勞動者無法提供由用人單位掌握管理的與仲裁請求有關(guān)的證據(jù)，仲裁庭可以要求用人單位在指定期限內(nèi)提供。用人單位在指定期限內(nèi)不提供的，應(yīng)當(dāng)承擔(dān)不利后果。