代駕司機違章闖紅燈的處理方式與一般駕駛員相同，通常會被罰款并扣分。

1. 代駕司機違章闖紅燈和普通駕駛員一樣，會面臨交通法規(guī)的處罰。依照相關(guān)規(guī)定，闖紅燈一般會被處以罰款200元，駕駛證記6分的處罰。

2. 一旦被電子警察抓拍或被交警現(xiàn)場查處，違法記錄將會被登記在車輛名下。如果代駕司機是通過正規(guī)代駕平臺接單，責(zé)任應(yīng)由代駕司機承擔(dān)。車主在收到違章通知后，應(yīng)及時聯(lián)系代駕平臺，由代駕平臺協(xié)助處理。

3. 代駕平臺通常會有相關(guān)的處理流程和規(guī)定。有些平臺可能會先行墊付罰款，然后再向代駕司機追償。也有些平臺可能會要求代駕司機自行處理違章并承擔(dān)相應(yīng)費用。

4. 如果代駕司機拒絕承擔(dān)責(zé)任，車主可以通過法律途徑來維護自己的權(quán)益。比如向法院提起訴訟，要求代駕司機承擔(dān)罰款和扣分的后果，以及可能因違章導(dǎo)致的車輛保險費用上漲等損失。

為避免此類糾紛，車主在選擇代駕服務(wù)時，應(yīng)盡量選擇正規(guī)、信譽良好的代駕平臺，并在代駕結(jié)束后確認(rèn)車輛狀況和行駛記錄。

《中華人民共和國道路交通安全法》 第三十八條

車輛、行人應(yīng)當(dāng)按照交通信號通行；遇有交通警察現(xiàn)場指揮時，應(yīng)當(dāng)按照交通警察的指揮通行；在沒有交通信號的道路上，應(yīng)當(dāng)在確保安全、暢通的原則下通行。

《中華人民共和國道路交通安全法》 第九十條

機動車駕駛?cè)诉`反道路交通安全法律、法規(guī)關(guān)于道路通行規(guī)定的，處警告或者二十元以上二百元以下罰款。本法另有規(guī)定的，依照規(guī)定處罰。