員工不配合工作能否開除，取決于具體情況。

1、如果員工不配合工作調(diào)整是合法合理的，勞動合同中有約定或者用人單位的規(guī)章制度中有規(guī)定，不服從崗位調(diào)動是嚴重違紀行為，那么單位可以依法受到處罰甚至解雇。但如果員工不配合工作調(diào)整是違法的，那么單位就不能以此為由解雇員工。

2、如果公司以“不能勝任工作”為由解除勞動合同，需要滿足以下條件：證明兩次不能勝任工作的事實，證明經(jīng)過培訓或者調(diào)整工作崗位的過程，支付經(jīng)濟補償金。如果員工不能勝任工作，經(jīng)過培訓或調(diào)整后仍不能勝任工作，用人單位可以解除勞動合同，但需要提前30天書面通知或支付一個月的額外工資作為補償。

《勞動法》第二十五條

勞動者有下列情形之一的，用人單位可以解除勞動合同:

(一)在試用期間被證明不符合錄用條件的;

(二)嚴重違反勞動紀律或者用人單位規(guī)章制度的

(三)嚴重失職，營私舞弊，對用人單位利益造成重大損害的;

(四)被依法追究刑事責任的。