肇事者付不起醫(yī)藥費時，法院會根據(jù)具體情況采取多種措施來保障受害者的合法權(quán)益。

1. 確認責任與賠償金額：法院首先會對事故的責任進行明確判定，并根據(jù)相關(guān)法律和證據(jù)確定應賠償?shù)尼t(yī)藥費金額。

2. 調(diào)查肇事者財產(chǎn)狀況：法院會對肇事者的財產(chǎn)進行調(diào)查，包括房產(chǎn)、車輛、存款、投資等。如果發(fā)現(xiàn)有可供執(zhí)行的財產(chǎn)，會依法采取查封、扣押、凍結(jié)等措施。

3. 強制履行賠償義務：若肇事者有工作收入，法院可能會要求其單位協(xié)助扣除部分工資用于賠償?；蛘邔σ巡榉?、扣押、凍結(jié)的財產(chǎn)進行拍賣、變賣，以所得價款支付醫(yī)藥費。

4. 引入保險賠償：如果肇事者購買了相應的車險，法院會要求保險公司在保險責任范圍內(nèi)承擔賠償責任。

5. 社會救助渠道：在特殊情況下，法院可能會協(xié)助受害者尋求社會救助機構(gòu)的幫助，如慈善組織、紅十字會等。

6. 執(zhí)行和解：法院也會鼓勵雙方進行執(zhí)行和解，即雙方協(xié)商達成一個雙方都能接受的賠償方案和履行方式。

總之，法院會盡最大努力保障受害者能夠獲得應有的賠償，維護法律的公平正義。但具體的處理方式會因案件的具體情況和相關(guān)法律規(guī)定而有所不同。

《中華人民共和國民事訴訟法》 第二百四十七條

發(fā)生法律效力的民事判決、裁定，當事人必須履行。一方拒絕履行的，對方當事人可以向人民法院申請執(zhí)行，也可以由審判員移送執(zhí)行員執(zhí)行。

調(diào)解書和其他應當由人民法院執(zhí)行的法律文書，當事人必須履行。一方拒絕履行的，對方當事人可以向人民法院申請執(zhí)行。