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可能會影響，一般夫妻感情確已破裂可以離婚。僅僅因為孩子有先天性疾病是不影響的，但是離婚后對孩子的撫養(yǎng)上兩人共同承擔。
人民法院審理離婚案件，應(yīng)當進行調(diào)解；如果感情確已破裂，調(diào)解無效的，應(yīng)當準予離婚。
有下列情形之一，調(diào)解無效的，應(yīng)當準予離婚：
（一）重婚或者與他人同居；
（二）實施家庭暴力或者虐待、遺棄家庭成員；
（三）有賭博、吸毒等惡習(xí)屢教不改；
（四）因感情不和分居滿二年；
（五）其他導(dǎo)致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失蹤，另一方提起離婚訴訟的，應(yīng)當準予離婚。
經(jīng)人民法院判決不準離婚后，雙方又分居滿一年，一方再次提起離婚訴訟的，應(yīng)當準予離婚。
《民法典》第一千零八十條
完成離婚登記，或者離婚判決書、調(diào)解書生效，即解除婚姻關(guān)系。
